集群是从中药材种植、饮片加工、制剂生产到市场物流的现代中药生产基地。在北部以睿鹰先锋制药、润泽制药等为依托，重点发展抗生素原料药、中间体等生物医药企业，形成了国内规模较大、技术先进、产品纯度高、产业链条长的头孢类、大环内酯类医药中间体、原料药生产基地。在西部以东美阿胶、大树食品为支撑，重点发展保健用品、营养食品、功能食品等健康食品基地，形成了国内规模较大、技术先进、产品纯度高、产业链条长的阿胶类、咖啡脂、营养调配剂生产基地。

菏泽高新区拥有大健康产业企业70多家，规模以上46家。2018年菏泽高新区医药产业销售收入220亿元，占全市医药产业总量的一半以上，助推菏泽市进入了山东省医药大市行列。高新区已开发面积约2100公顷，其中大健康产业用地580公顷，累计固定资产投资约250亿元，实现生产总值70亿元，2018年集群实现销售收入220亿元，照此计算，工业建筑容积率1.02，单位工业用地平均投资达到4333万元/公顷，单位工业用地平均销售收入达到3800万元/公顷；同时产业集群中医药主导产业2018年销售收入为220亿元，占比60.6%，主导产业规模和水平处于国内同行业前列，拥有多家业内骨干企业。

现代中药生产、抗生素原料药、中间体等生物医药企业。

步长制药集团、睿鹰先锋制药集团、方明制药集团、健民制药、华信制药、海王药业、华润医药、普恩制药、润生药业、葆年堂药业、伽华制药、三仪制药、天草药业、葆年堂等。

现代中药生产、抗生素原料药、中间体等生物医药企业。

菏泽市建立了由市长为召集人，市委市政府分管领导、市直相关部门负责人参加的菏泽高新区医药产业建设发展联席会议制度，在菏泽高新区成立由管委会主要领导任组长的特色产业基地建设领导机构。
       健全金融科技、中介咨询等服务能力，确保医药产业发展取得实效设立“菏泽医药产业决策咨询委员会”，为医药产业发展提供重大项目或问题决策咨询。
       设立鲁信菏泽高新产业投资基金，充分发挥政府引导作用。设立菏泽高新区生物医药产业投资发展公司，建立多元化股权构成的专业化、市场化运作的产业投资机构。
       设立或引进社会化中介服务机构，采取“以市场为导向、产权为纽带、政府支持、业主开发、企业化运作”的方式组建，参与基础设施建设、研发项目和企业孵化、创新人才培育、项目分析与评估等工作。加快高新区创业服务中心等功能载体建设。